林深站在厨房，手里拿着牛奶瓶，却一脸茫然。冰箱门上贴着一张便利贴，上面写着“周三下午三点会议”，还画着个笑脸。可他满心都是疑惑，自己明明清楚地记得，昨天还在和客户谈那个重要的项目，怎么今天突然就跳到周四了呢？这中间的周三，像被一块橡皮擦得干干净净，毫无痕迹。
他匆匆穿上衣服，一路小跑来到公司。刚进办公室，就感觉同事们投来的目光怪怪的。同事小李走过来，递过来一杯咖啡，轻声说：“林深，你这脸色不太好啊。”林深勉强挤出个笑容，刚想开口问周三的事，手机突然“叮”的一声，收到一条匿名短信：“别相信任何人”。他心头一紧，赶紧查看手机相册，周三那天的相册里全是乱码，怎么都打不开。
到了中午，他去洗手间，在镜子前仔细端详自己。这一看，他差点叫出声来，脖子右侧不知什么时候出现了一个黑色星状疤痕，以前从来没有啊。他正对着镜子发愣，身后传来“咔嚓”一声快门声。他猛地回头，只见一个清洁工低着头，手里拿着手机，快步走了出去。林深心里犯起了嘀咕，这清洁工怎么会偷偷拍他呢？
第二章：碎片拼图
林深决定先去图书馆查查资料，看看能不能找到关于自己这种情况的线索。在图书馆里，他翻找相关书籍的时候，一本《量子力学简史》里飘落出一张泛黄的实验记录页，上面写着“海马体电磁脉冲实验”，签名处是模糊的“苏教授”。他还没来得及细想，手机突然收到一条陌生号码的彩信，照片上是他自己在周三深夜潜入公司机房的背影。
晚上，林深回到家，发现门缝里塞着一封信。他打开一看，是心理医生程露的警告信，信上说“停止追查”。可他刚看完信，程露的电话就打了过来，电话那头传来她焦急的声音：“林深，你一定要找到我抽屉里的银色U盘，里面藏着真相。”林深刚想问怎么回事，电话里突然传来一阵嘈杂声，然后就断线了。
林深马不停蹄地赶到程露的诊所，诊所一片混乱，电脑主机还在冒烟。他在程露的抽屉里找了半天，终于找到了那个银色U盘。插入电脑后，屏幕上出现的却是一段加密代码。他正盯着代码发愁，突然发现代码倒影中映出窗外有个人影，他抬头一看，正是那个清洁工。
第三章：双生镜像
清洁工老周看到林深发现自己后，缓缓摘下帽子，露出一张和林深一模一样的脸。林深惊得差点跌坐在地，老周说：“我叫林渊，是你的双胞胎哥哥。”林深怎么也不敢相信，自己竟然还有个哥哥。
林深把林渊带到了一个安全的地方，林渊拿出那本《量子力学简史》，书里夹着一份1998年的实验报告，上面显示他们兄弟俩是“记忆移植实验体”。林深看着报告，脑袋一阵发晕，原来自己的身世这么复杂。
这时候，电视新闻正在播报科技巨头“黑穹”公司实验室发生爆炸的消息。林深仔细一看，画面中闪过的一个安全标识，和程露诊所电脑上的标识一模一样。他突然意识到，这一切似乎都和“黑穹”公司有关。
第四章：时间陷阱
林深和林渊根据线索，潜入了“黑穹”公司的地下三层。里面阴森恐怖，到处都是服务器。他们打开一些服务器，里面存着数千份“记忆清除协议”，客户名单里竟然包括多位政要。林深看得心惊肉跳，这背后到底隐藏着多大的阴谋啊。
突然，他们遇到了安保主任。林深一看，这安保主任竟然是程露。程露冷笑一声，启动了倒计时装置，说：“你们以为能揭开真相吗？太天真了。”林深看着程露，又看看一旁的林渊，心中充满了疑惑。
就在这时，林深在一份文件里发现了自己签署的《自愿成为实验体》电子合约，日期是三年前。他怎么也想不起来自己签过这个合约。林渊看着他，无奈地说：“我们可能一直都被卷入了这个巨大的阴谋中。”
第五章：黑洞边界
林深和林渊在实验室里四处寻找线索，终于找到了一台原始实验录像。录像里显示，他们兄弟俩的记忆被编码成了量子纠缠态，有人正在试图制造“人造时空裂缝”。这简直是天方夜谭，可证据摆在眼前，由不得他们不信。
就在他们准备进一步查看时，实验室里突然出现了黑衣人。这些黑衣人行动敏捷，朝着他们冲了过来。林深和林渊拼命逃跑，在逃亡途中，林深不小心误触了一个装置，街道突然陷入了1987年的暴雨夜。周围的一切都变了样，他们仿佛穿越到了过去。
这时，林深的手机收到了母亲临终前未发送的语音：“小深，快逃到没有电磁信号的地方。”林深听着母亲的话，眼泪忍不住流了下来，他知道，自己必须尽快解开这个谜团，逃离这个可怕的地方。
第六章：记忆坍缩
林深和林渊根据母亲的提示，来到了一个荒岛。可没想到，程露带着雇佣兵也追到了这里。一场激烈的对峙开始了，双方僵持不下。就在这时，林渊突然拿起一块石头，做出了自毁举动。瞬间，所有电子设备都黑屏了。
没有电子设备的干扰，林深突然感觉脑袋一阵剧痛，记忆如潮水般涌来。他想起周三那天，自己为了保护程露，亲手删除了她的犯罪证据。原来，一切都是这么复杂，他一直在无意识中被卷入了这个阴谋。
就在林深沉浸在回忆中时，沙滩上浮现出一个刻着“第二阶段实验体存活率0.03%”的金属碑。远处，直升机的轰鸣声越来越近，新的危机又来临了。林深望着金属碑，心中充满了迷茫，不知道接下来等待他们的会是什么……
